Глобальные изменения в системе налогообложения, такие как введение ЕНП в 2023 году, обычно не остаются без последствий. Часто спорные моменты приходится разбирать в судебном порядке. За неправильное применение законодательства могут ответить и налоговые органы.
Е. П. Булгакова, аудитор
Ситуация
Федеральное государственное бюджетное учреждение (далее — учреждение, заявитель) обратилось в Арбитражный суд с претензией к ИФНС России по городу (далее — ИФНС, инспекция) о неверном формировании сальдо ЕНС по состоянию на начало 2023 года и неправильном начислении по налогам и сборам пени на недоимку, признанную безнадежной к взысканию.
Суть дела
Решением Арбитражного суда признаны безнадежными к взысканию недоимка по НДС в размере 7 355 044 рублей, а также соответствующие суммы пеней. Данное решение вступило в законную силу, инспекцией обжаловано не было.
Через некоторое время ИФНС снова объявила учреждению о наличии задолженности по НДС за этот же период.
Заявитель, полагая, что инспекцией произведен расчет совокупности налоговых обязательств без учета того, что вступившим в законную силу решением суда признана безнадежной к взысканию недоимка в размере 7 355 044 рублей, обратился за помощью к служителям Фемиды (постановление Девятого Арбитражного апелляционного суда от 19 января 2026 г. № 09ап-56047/2025).
Мнение судей
Доводы ИФНС в рассматриваемом деле полностью дублируют заявленные ей в рамках предыдущего дела и сводятся к тому, что задолженность по НДС, вошедшая в состав сальдо ЕНС по состоянию на начало 2023 года, составляет 1 034 967 рублей в результате внутренних взаимозачетов, а также с учетом частичного погашения ЕНП.
Вступившим в законную силу решением суда, имеющего преюдициальное значение[1] для разрешения настоящего спора, задолженность по НДС за рассматриваемый период в размере 7 355 044 рублей признана безнадежной к взысканию.
Доводы инспекции касательно частичного погашения заявителем задолженности, а также исчисленной на этом основании недоимки по указанному налогу в размере 1 034 967 рублей и соответствующих сумм пеней были отклонены.
Поскольку задолженность по НДС и соответствующие суммы пеней признаны безнадежными к взысканию, осуществленные учреждением платежи за рассматриваемый период в общем размере 6 320 077 рублей (7 355 044 рублей (признанная безнадежной сумма недоимки по НДС) минус 1 034 967 рублей (отраженная инспекцией сумма задолженности по НДС) не могут быть учтены в счет погашения данной недоимки, а подлежат зачету в счет уплаты совокупной обязанности налогоплательщика в составе сальдо ЕНС по налогам (сборам, страховым взносам, пеням, штрафам, процентам) за иные периоды, что не исключает образование положительного сальдо в результате перерасчета с учетом исключения признанных безнадежными к взысканию сумм (недоимка и соответствующие суммы пеней).
Инспекция в своих возражениях указала, что денежные средства, поступившие на ЕНС, участвовали в погашении общей совокупности обязанности налогоплательщика, имеющейся на ЕНС на дату поступления платежа, а не конкретной обязанности по налогу, указанной учреждением.
