Минфин России в письме от 1 сентября 2016 г. № 03-07-11/51102 рассмотрел вопрос применения НДС в отношении осуществляемых федеральным государственным учреждением уголовно-исполнительной системы операций по внутрисистемной реализации товаров, произведенных с привлечением другого федерального государственного учреждения уголовно-исполнительной системы.
На основании подпункта 11 пункта 3 статьи 149 Налогового кодекса не облагается НДС внутрисистемная реализация (передача, выполнение, оказание для собственных нужд) организациями и учреждениями уголовно-исполнительной системы произведенных ими товаров (выполненных работ, оказанных услуг).
Поэтому операции по внутрисистемной реализации товаров, осуществляемые федеральным государственным учреждением уголовно-исполнительной системы, в том числе произведенных с привлечением другого федерального государственного учреждения уголовно-исполнительной системы, не облагаются НДС.