По вопросу обложения налогом на доходы физических лиц стипендий студентов учреждений высшего профессионального образования Минфин России в письме от 3 июля 2012 г. № 03-04-05/3-825 разъяснил, что в соответствии с пунктом 11 статьи 217 Налогового кодекса не облагаются НДФЛ стипендии учащихся, студентов, аспирантов, ординаторов, адъюнктов или докторантов учреждений высшего профессионального образования или послевузовского профессионального образования, научно-исследовательских учреждений, учащихся учреждений начального профессионального и среднего профессионального образования, слушателей духовных учебных учреждений, выплачиваемые указанным лицам этими учреждениями, стипендии, учреждаемые президентом РФ, органами законодательной (представительной) или исполнительной власти, органами субъектов, благотворительными фондами, стипендии, выплачиваемые за счет средств бюджетов налогоплательщикам, обучающимся по направлению органов службы занятости.
Таким образом, стипендии студентов учреждений высшего профессионального образования освобождаются от обложения налогом на доходы физических лиц.
Вместе с этим оснований для освобождения от обложения налогом на доходы физических лиц выплачиваемой студентам учреждений высшего профессионального образования из стипендиального фонда ежемесячной надбавки к стипендии в статье 217 Налогового кодекса не содержится.